يعد مرضى برادر ويلي أكثر عرضة للإصابة بأمراض الجهاز التنفسي ويجب حمايتهم. حيث تعتبر الانفلونزا عدوى خطيرة تصيب الجهاز التنفسي وقد تشكل خطراً على حياة المصاب ويجب الوقاية منها عن طريق اللقاح السنوي وغسل اليدين باستمرار. يوصى بإعطاء لقاح الإنفلونزا بعد عمر الـ 6 شهور خاصة للأفراد الأكثر عرضة لخطر الإصابة. ويعد مرضى برادر ويلي من ضمنهم ويجب تلقيحهم.
وعلى الرغم من أنه ورد ذكر أنه يمنع استخدام هرمون النمو في حالات السمنة المفرطة ومشاكل الجهاز التنفسي، إلا أن هذا لا يعني أن هرمون النمو سيزيد أعراض الأمراض التنفسية سوءاً. ولا يوجد دليل أن إيقاف هرمون النمو في أثناء الإصابة بأحد أمراض الجهاز التنفسي سيفيد بأي شيء.
الالتهاب الرئوي هو مصطلح واسع يغطي العديد من أنواع الالتهابات. يتم تطعيم جميع الأطفال لبعض أنواع الالتهاب الرئوي (HIB). وهناك تطعيمات ضد الالتهاب الرئوي تُعطى في سن 65 عامًا، وتطعيم ضد الالتهاب الرئوي (بريفنار) يُعطى للأشخاص الذين يعانون من أمراض معينة؛ وهذه لا تشمل متلازمة برادر ويلي.
يعد معدل الوفيات بسبب حوادث التنفس أعلى من المتوسط بين مرضى برادر ويلي وقد يشمل هذا حوادث الاختناق بالطعام، وصول السوائل إلى الرئتين أثناء البلع، انقطاع النفس أثناء النوم، والالتهاب الرئوي.
الالتهاب الرئوي هو عدوى تصيب الرئتين قد تؤدي إلى فشل رئوي والحاجة إلى جهاز التنفس (المنفسة) حيث تمتلئ الأكياس الهوائية الصغيرة في الرئتين بالسوائل. يمكن أن يكون الالتهاب الرئوي ناتجًا عن فيروس أو بكتيريا. من غير المعروف نسب الإصابة أو ماهي أنواع الالتهاب الرئوي الأكثر شيوعا بين مرضى برادر ويلي.
تتطلب عملية التنفس الطبيعية تحكم من الدماغ وقوة في العضلات (عضلات الفم والحلق والحجاب الحاجز والضلوع). فقوة العضلات وتحكم الدماغ بالإضافة إلى التتزامن في عمل العضلات المختلفة أمر مهم جداً لحدوث السعال الذي يعد من أهم وسائل الوقاية من الالتهاب الرئوي. إلا أن تحكم الدماغ وقوة العضلات أضعف عند مرضى برادر ويلي مقارنة بغيرهم. ومع وجود الأدلة على دخول السوائل إلى الرئة بدل دخولها إلى المعدة بسبب مشاكل البلع فإنه من المتوقع أن تكون صحة الرئتين معرضة للخطر مع متلازمة برادر ويلي. إذا كان طفلك قد أصيب مرات عديدة بالالتهاب الرئوي فمن الضروري الأخذ بعين الاعتبار وجود خلل في عملية البلع حيث تذهب السوائل إلى الرئتين عوضاً عن المعدة.